IBM commercialisera la lecture du génome

IBM s'est associé à Roche, fabricant de dispositifs médicaux La société a annoncé jeudi que la technologie pourrait être à dix ans ou plus de la commercialisation, mais une fois terminée, elle devrait offrir à tous les médecins un moyen peu coûteux et rapide Ajay Royyuru, directeur principal de la biologie computationnelle chez IBM Research.

"Le coût du séquençage du génome a baissé, et la vitesse a commencé à s'améliorer, mais il y a toujours des problèmes de vitesse, d'échelle, le débit, ainsi que le coût », a déclaré Royyuru.

Le projet utilisera« DNA Transistor »d'IBM. Ces transistors contiennent des nanopores, ou de très petits pores, à travers lesquels un brin d'acide désoxyribonucléique (ADN) peut être utilisé. Le nanopore identifie chaque base de l'ADN en utilisant un champ électrique.

Parce que le nanopore est en partie fabriqué à partir de silicium, il devrait pouvoir être produit en masse par les mêmes techniques de lithographie que celles utilisées pour fabriquer des microprocesseurs.

Alors que d'autres chercheurs ont également exploré l'utilisation des nanopores, de tels modèles ne peuvent pas lire correctement l'ADN, car l'ADN se déplace trop rapidement à travers les pores.

"C'est comme si on aspirait des spaghettis. Ça bouge très vite, nous avons vu passer 48 000 unités d'ADN en 10 ou 20 millisecondes, et à cette vitesse, vous avez très peu de chance de le lire correctement, "dit Royyuru.

Pour ralentir La vitesse de l'ADN, IBM a conçu sur le nanopore un contrôle électrique pour faire glisser le flux à la vitesse désirée. "Nous pouvons contrôler électriquement le mouvement de l'ADN à travers le pore, nous pouvons le faire unité par unité", at-il dit.

Bien que les technologies de séquençage de l'ADN existent depuis le début des années 1970, l'ensemble du génome humain n'a pas été entièrement décodé. jusqu'en 2001, en raison de l'automate nécessaire pour décoder le grand nombre de paires de bases qui doivent être lues. L'ADN de chaque personne contient environ 3 milliards de paires de bases de nucléotides.

Alors que la technologie de séquençage de l'ADN s'est améliorée depuis, il en coûte encore quelques centaines de milliers de dollars pour lire un génome humain entier. Une fois prêt, cet appareil devrait être en mesure de faire le travail entre 100 $ et 1 000 $ par lecture, a estimé Royyuru. Royyuru a refusé d'offrir un moment où la machine serait disponible dans le commerce, citant les nombreuses étapes nécessaires pour apporter technologie radicalement nouvelle à la production. Il a estimé qu'il faudrait environ cinq à dix ans pour terminer la recherche seul.

La filiale de séquençage de Roche, 454 Life Sciences, commercialisera finalement les produits issus de cette collaboration. Selon M. Royyuru, IBM apportera son expertise dans le domaine de l'électronique et de la gestion des données, tandis que Roche appliquera ses connaissances en matière de diagnostic médical et de séquençage du génome. Plus particulièrement, il permettra aux médecins de «personnaliser l'approvisionnement des soins médicaux», a-t-il dit. Par exemple, de nombreux médicaments vont travailler sur certaines personnes, mais pas toutes. Avoir l'ADN d'une personne en main aidera le médecin à prescrire le médicament approprié. De plus, la lecture du génome peut révéler une susceptibilité à certaines maladies.

Une autre utilisation précoce pourrait peut-être être de déterminer combien de temps les individus peuvent vivre. Jeudi, des chercheurs de l'Université de Boston ont annoncé qu'ils avaient trouvé ce qui semble être des signatures génétiques de la longévité.

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